Ekrem İmamoğlu'nun üniversite diplomasından sonra yüksek lisans diplomasının da iptal edilmesi çok tartışıldı. Gazeteci Musa Ağacık, Prof. Dr. Metin Sözen'in cenazesine katılan İstanbul Üniversitesi eski Rektörü Prof. Dr. Kemal Alemdaroğlu'na, diploma iptaline dair yorumlarını sordu. Alemdaroğlu şunları söyledi:

"O ZAMANLAR ÜNİVERSİTENİN DENKLİK DİYE MEVHUMU YOKTU"

"İmamoğlu'nun diplomasını iptal eden, bu işten hiç anlamayan insanlardır. Yatay geçiş 1990 yılındaki yatay geçiş yönetmeliğinde geldiği üniversitenin denklik diye bir mevhumu yoktu. Yatay geçişte denklik aranmazdı. Sadece sınıfı geçmiş mi, bire mi, ikiye mi, üçe mi geçmiş... Son sınıfa yatay geçiş olmazdı. O kadar... Notlarına bakılırdı. Yatay geçiş mezuniyetten sonra bakılan, diplomaya bakılan bir şeydir. O da 2010 yılında oldu. Bilen de konuşuyor bilmeyen de konuşuyor. Ekrem İmamoğlu'nun diplomasını, o yetmedi yüksek lisansını iptal ettirmek sadece siyasi, adaylığından korkulma... ". Ağacık'ın "Bilim ahlakı diye bir şey yok mu... Üniversite bunu nasıl yapar" sözlerine ise Alemdaroğlu "Bu işletme fakültesinde iptal olurdu. Dekan istifa etti, dekanı zorladılar" yanıtını verdi.