5.Tur'u geçen 16 takımın katılacağı ve çift maç eleminasyon sisteminin uygulanacağı Ziraat Türkiye Kupası Son 16 Turu'nda ilk maçlar 15, 16 ve 17 Ocak 2019 tarihlerinde, rövanşlar ise 22, 23 ve 24 Ocak 2019 tarihlerinde oynanacak.
Eşleşmeler
Aytemiz Alanyaspor - Kasımpaşa
Evkur Yeni Malatyaspor - Bodrumspor
Ümraniyespor - Fenerbahçe
Balıkesirspor - Trabzonspor
Boluspor - Galatasaray
Başakşehir - Hatayspor
Kayserispor – Akhisarspor
Ziraat Türkiye Kupası Son 16 Turu takımları şöyle:
Seri başı takımlar
Evkur Yeni Malatyaspor
Fenerbahçe
Galatasaray
Göztepe
Kasımpaşa
Kayserispor
Medipol Başakşehir
Trabzonspor
Seri başı olmayan takımlar
Akhisarspor
Antalyaspor A.Ş.
Aytemiz Alanyaspor
Balıkesirspor Baltok
Bodrum Belediyesi Bodrumspor
Boluspor
Hatayspor
Ümraniyespor